由於protein man 的世界是由多個平行世界重疊而成，因此不同世界獨特的能力全都濃缩進主世界。而這也導致大量的牛鬼蛇神出現在主世界中。以下將會介紹不同的能力使用者。
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凡人:最為普通的一羣人，戰鬥力非常一般。會使用王八拳，嘴炮和奇蹟之力(好運或是暫時的主角光環)
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生化人:對身體進行肢體改造的人。在賽博朋克的時代，肢體改造是非常正常。例如工人會装備不同的萬用工具義肢以應付日常工作。
然而有些改造狂或黑幫分子會為酷炫外表或是强大的火力輸出而對身體進行超大幅度的義肢改造。261Please respect copyright.ＰＥＮＡＮＡjWqPYYrHwF
這除了會造成重量負擔外，也會構成潛在的生命威脅。鑑於貧民窟裏所流通的組件大多是在垃圾堆找到或是粗制濫造的三流貨。它們容易發生短路或是自爆。
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因此一些使用者會在無缘無故的情况被炸掉半邊身子。261Please respect copyright.ＰＥＮＡＮＡx4BX6Wmwja
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身體改造者:能夠改變自己的身體結構者。一般改造者分為藥物改造者以及自體改造者。藥物改造者故明思意是指利用藥物改造或強化自身身體。
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改造藥效果一般持續數小時或是數天。長期使用改造藥會對身體造成負面的永久性影響，甚至會危及性命。第六章的中分頭便是其中一名。
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自體改造者是指身體能夠自行改變自己的身體結構。一般的改變源自於獨特的酶體或是特殊的骨骼、肌肉、內臟結構。主角小明便是其中之一。
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武神召喚者:能夠從英靈殿召喚武神附於自己身上並使用他的能力。召喚者整個背部覆蓋著一層紋身，那是武神與召喚者所訂立的契約。 故事初期的刀客、小明以及中期的俄羅熊便是其中之一。使用者除能繼承武神的能力外，也會繼承到祂的性格、習慣等。
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魔法師:泛指能夠使用魔法的人。當中又包括咒術師、英靈召喚師、全能者、強化師等等。女主、教主及肌肉狂便是其中之一。
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其他/未知能力使用者:擁有未知或是獨特的能力。原因不明(作者也不知道!!)這些能力使用者一般數量稀少，但擁有強大甚至顛覆世界的能力。一星和第二部才出現的拓也哥便是其中之一。
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此為protein man世界內大部分的能力介紹。若有新的點子將會遲些補上。261Please respect copyright.ＰＥＮＡＮＡTfa74S1EqF
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