顯道十七年,寄居地球華夏帝國的外星人開普勒星人透過建立太空站,促成地球各國與外星人發展太空貿易。開普勒星人杰娜女皇視之為自己的政績,以及送給她的愛人華夏帝國女皇譚傑靈的厚禮,但卻遭到其他外星人警告,指地球人貿然接觸其他外星人,或會增加爆發傳染病的風險。果然,不出所料,太空站果然爆發不明的傳染病,由SPACE-19希毒引發的「太空瘟疫」;包括杰娜後宮妃嬪在內的地球人和開普勒星人紛紛染病,有無病徵,有的輕微發燒、咳嗽後自行痊癒,有的卻重症昏迷甚至死亡。開普勒星人成為眾矢之的,被人類批評為「病毒來源」,邪教亦乘機散佈「開普勒星 人製造病毒侵略地球」的陰謀論;杰娜為了挽回人類的信任,決心防疫。
傑靈和杰娜分別命令自己的太醫蔡采文以及開普勒星人御醫赫爾塔,成立醫學小組,研究應對策略。但二人馬上就捲入黨爭之中。除了華夏帝國朝廷對開普勒朝廷的官員抱有懷疑之外,醫學團隊亦因為醫方問題而起了紛爭。西醫利爾雅與韓醫許俊水火相容,各不相讓,又在傳媒鏡頭前胡言亂語,引起社會恐慌。
雖然傑靈責成華夏朝廷全力防疫,但武官出身的首相高倩影卻對采文和赫爾塔這些科學家極不信任,更因為傑靈信任采文而感到妒忌。因此,倩影的內閣對采文的科學團隊不但未有提供充分支持,反而煽動利爾雅在太醫院裡進行權鬥,更隱暪軍中爆發太空瘟疫。為了避免華夏朝廷內權鬥影響防疫,傑靈索性要求防疫小組改由開普勒朝廷首相艾莉皇妃統領;這反而進一步挑起兩朝廷內閣之衝突,亦進一步加劇民間對開普勒星人的反感。
與此同時,傑靈懷疑病毒並非源自太空,而是與倩影多年前強行解散的「漢口實驗室」有關,因而派四大侍衛——劉莉莎、文本德、上原志美和巴里杜邦調查。發現漢口實驗室人員不少皆為開普勒星人而非人類,更懷疑他們已滲透太醫院,於是就對開普勒星人進行調查;但消息卻遭到洩露,反而加深民間抹黑「開普勒星人製造病毒」的陰謀論,令民間仇恨外星人情緒進一步高漲。
疫情進一步擴散,大量人民染病,病死者甚眾,死亡率急升,九龍府封關,停課,百業蕭條,民不聊生。倩影內閣主張全國戒嚴,想乘機加強監控臣民,卻遭到傑靈決絕;傑靈接納采文和赫爾塔提議的「溫和指施」,在大齋期四十日內規勸臣民留家。正當太醫院研究團隊在藥物臨床測試時取得突破進展時,病毒竟然突然變種,甚至皇宮內出現疫情爆發,大批皇室染病,甚至連傑靈和杰娜的子女也不得幸免⋯⋯
到底傑靈和杰娜如何帶領人類與開普勒星人克服太空瘟疫的危機?采文與赫爾塔能否成功研製出藥物根治太空瘟呢?四大侍衛又能否找出製作病毒的元兇呢?到底是誰,為了甚麼目的,要製造這場瘟疫害人?
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