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故事以旁觀者・中學生鹿目圓的視角,描寫以實現願望為代價的「魔法少女」與敵人作戰的嚴酷命運。
本作旨在對魔法少女的定型文本引入創新性[15],與其說是魔法少女(角色)的故事,更接近以魔法少女為創作主題的黑暗奇幻・心理驚悚作品。
日文原文名稱的「マギカ」譯自拉丁語的“Magica”一詞,是“magicus”的陰性型態,意譯為「魔法的」,但在官方中譯「魔法少女小圓」中被省略了。
故事舞台位於虛構的見瀧原(日語:見滝原/みたきはら Mitakihara)市。
城中充斥著可能實現的新科技,因此劇中的現代世界充滿未來感,許多建築物以杜拜、美國、歐洲與日本群馬縣的真實建築為範本。
在設定中,見瀧原是近幾年新開發的地方都市,新興住宅區毗鄰人工的景觀綠地以及小溪,郊外則有風力發電設施、水門以及工廠等。見瀧原作為行政區,有時被稱為「市」,有時則又是「町」,官方資料並未統一。
然而,早在史前時代全世界就有許多魔法少女了,歷史藉由她們的暗中活躍而被推動,包括克麗奧佩脫拉七世、卑彌呼、聖女貞德等史實人物都在其中。
此外,被魔女盯上的人,則會原因不明地自殺或殺人。
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