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逃學小魔仙小千為尋找母親而逃到人類世界，小藍奉命追尋，在人類世界再遇美琪、美雪。
與此同時，環繞着魔仙堡的彩虹能量忽然消失了，因為魔仙堡受到了邪惡的巫神天龍襲擊，破壞了魔仙堡能量之源--彩虹之花。
發出七色光芒的彩虹之花本是維繫着整個魔仙堡的巨大能量來源，如今變得暗淡無色，逐漸枯萎，魔仙堡也因而失去能量，逐漸下沉至湖底，危在旦夕；魔仙女王利用法力暫時保護着魔仙堡，正在束手無策之際，小藍、美琪、美雪、小千得知魔仙堡中有一本「彩虹筆記」，記載了有關彩虹之花的歷史，並得千年花精靈詩詩的幫助，找到挽救魔仙堡的方法。
原來要修復彩虹之花，要先為七枚「彩虹心石」收集能量，七枚心石分別代表七種正能量：勇氣、正義、憐憫、寛恕、關愛、無私，女王指派小藍、小千、美琪、美雪、遊樂、青青離開魔仙堡收集宇宙正能量以修復彩虹之花，但巫神指派使者不斷阻撓各人收集能量。
小千之母魔仙若琳當年逃離魔仙堡後，被巫神所利用，迷失了本性，成為巫神使者水靈，並使出一切手段對付各人，展開一段正邪之戰。
各人盡力為彩虹心石收集能量，六枚彩虹心石先後成功充滿能量，唯獨其中一枚，毫無進展，幾乎令各人功虧一簣，幾經轉折，當魔仙若琳發現女兒就是小千，甘願為小千犧牲，便為最後一枚代表「無私」的心石收集了足夠的能量，「彩虹之花」亦因而復甦，拯救了魔仙堡，解除了一場危機。
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