簡答
自然之惡問題是指如果上帝是全能、全知與全善的話，則自然之惡不可能發生。
釋義
自然之惡是指非人為而引致人類承受的苦難。人為之惡是人自由意志引致的，故然不能要求上帝負責；但自然災害令不少生靈塗炭，則難免令人質問上帝「為何上帝容許此事發生」，進而質疑自然之惡根本與上帝全能、全知與全善的屬性相違。其論證如下：
假設上帝全能，則上帝能夠制止自然之惡發生，然而自然之惡依然發生。於是就只有兩種可能性：上帝不知道自然之惡發生，或是上帝願意自然之惡發生。然而，若上帝不知道自然之惡發生，則上帝不是全知；若上帝全願意自然之惡發生，則上帝不是全善。
假設上帝全知，則上帝知道自然之惡發生，然而自然之惡依然發生。於是就只有兩種可能性：上帝不能制止自然之惡發生，或是上帝願意自然之惡發生。然而，若上帝不能制止自然之惡發生，則上帝不是全能；若上帝全願意自然之惡發生，則上帝不是全善。
假設上帝全善，則上帝不願自然之惡發生，然而自然之惡依然發生。於是就只有兩種可能性：上帝不能制止自然之惡發生，或是上帝不知道自然之惡發生。然而，若上帝不能制止自然之惡發生，則上帝不是全能；若上帝不知道自然之惡發生，則上帝不是全知。
故得證「上帝為全能、全知且全善」與「自然之惡發生」互相矛盾。
要回應此質疑，可從兩種方向：（一）質疑上文對全能、全知及全善之演繹，（二）否定「自然之惡」存在。
上文對全能、全知及全善之演繹如下：
- 全能則上帝能夠制止自然之惡發生，
- 全知則上帝知道自然之惡發生，及
- 全善則上帝不願自然之惡發生。
最後一點卻與「全善」之本性不一致。上帝全善不代表上帝不願自然之惡，因為「自然之惡」不一定與善意相違。苦難可以是上帝審判，如以天火災城，滅所多瑪、俄摩拉；也可以是試練。再者，廣義來說，自然災害是人類墮落後所直接承受的審判。人類離開永恆的上帝，被逐出無苦難的伊甸園，即進入有苦難的世界。
所以，如果我們將自然之惡視為人類因墜落而面對審判，那麼自然之惡就不再「自然」，其實也是道德之惡，則自然之惡根本不存在。地震、颱風、火山爆發等「災害」，本來就無善惡，無福災，只是有人先居於此處，受之影響，因而斷定這些自然現象為「惡」。因此，所有自然災害，最終仍是由於墮落後人被投擲於世間所致。
聖經經文
你們行事若與我反對、不肯聽從我、我就要按你們的罪加七倍、降災與你們。（利未記26:21）
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