在鬧劇結束後，我本來應該按照菲莉婭的意願被銷毀，但軍方高層想要把桑納托斯系列化而偷偷保留，並且試圖駭進系統獲取相關資訊。於是我不但封鎖駕駛艙及系統，只要他們靠近桑納托斯，我都會啟動渡神作警告。
無奈之下，那些軍方高層想要透過與菲莉婭有些交情的聯合部隊讓我放下戒備。但是我不希望她會再回來，絕對不要。
所以依然不願讓任何人操作，只允許少數人乘上去交流。其中一個便是艾恩，只因為他是菲莉婭的同學，比較熟悉而已。其次就是亞爾諾德，當他知道關於菲莉婭的事後，就反對讓我繼續存在。但逼於高層壓力，只好讓人進行保養。但他表明不會讓任何人來取得關於桑納托斯的製作資料，但條件是我必須參與他們的行動。於是我整整一年的時間都在協助他們。然後她又回來了。
多虧艾莉絲他們製造出來的裝置，我得以與菲莉婭交流。同時都能夠在桑納托斯無法觀察的地方與她一起。即使很高興能夠再見到她，我倒希望她不要再回來。
雖然從鏡頭看到菲莉婭與之前相比眼神沒有那麼空洞，但仍會為她不愛惜自己一事感到擔心，畢竟她在這方面有前科嘛！當然會擔心吧！
然後就遇見她的雙胞胎姐妹琥珀，以我對她的了解，菲莉婭一定認為父母把她視作怪胎而拋棄她。她在這方面極度容易鑽牛角尖。
果然她真的在鑽牛角尖，幸好她的雙胞胎姐妹猶如一個好奇寶寶一樣想要了解她，讓艾莉莎將她帶到我這裡，她才開始理解菲莉婭的過去。見她願意接納菲莉婭，我都放心了。只差在讓她脫離軍隊，這樣她就可以作為普通人生活下去。
只有離開這裡，她才能夠獲得幸福。為此我可以用上任何手段，包括自我毀滅。只是以菲莉婭的狀態，有機會會跟失去傑斯時一樣。而這個猜想在西非時得到印證。
似乎是出於對繆絲歌劇院受害者的愧疚，她不願意進行迴避或是防禦，選擇把這一切嚥下。這個笨蛋……不是應該開始努力過活嗎？怎麼又打回原形？既然她對他們心存愧疚，那就面對面承受，不要用這種玩命的方式！於是我啟用渡神把對方機體四肢給切斷，讓桑納托斯不再受到任何損傷。
不過，我沒想到這麼快就遇上菲莉婭中學時期的好朋友——米亞，而她更是恨得要射殺菲莉婭！當我見到她中槍倒地時，我的中央處理器頓時無法運作。我多麼害怕她就此死在這裡。明明是希望她可以生活在平民當中，找到屬於自己的幸福。現在找回親人，卻死在異鄉。這樣……我無法接受，我寧願中彈的是我。
我當下差點就想要下手把米亞殺死，不論是要用光束、利用鋼鐵身軀把她踩死、或是直接抓在手中掐死也好，那孩子從未抓緊幸福就要死，還要是被她的朋友所殺。任誰也無法接受吧？
要不是艾恩及梅行動夠敏捷，即時進行急救，我恐怕要暴走了。失去她的話，我再也沒有存在的必要了。
或者是知道我的想法，布切斯頓艦長馬上安排人們看管著我，同時聯絡某人。
在菲莉婭搶救期間，艾莉絲及菲利奧等人製造的裝置一直被艾恩保管著。而米亞則被監禁。
過了段時間後，菲莉婭醒來，琥珀都出於擔心前來探望兼看顧她，希望她好好愛惜自己。看來真的有必要讓她徹底離開這裡，但是以目前的情況，她還是會輕易的死翹翹，所以要有一個契機讓菲莉婭自身願意活下去。但萬萬都沒想到這個契機突然出現。
記得那個前來追殺菲莉婭的殺手嗎？她帶著菲莉婭的複製人前來投降。琥珀出於好奇接近這個小菲莉婭，正當她在猶豫是否該說出自己的身份時，探測到菲莉婭似乎向那個複製品傳達了甚麼，讓她說出自己是菲莉婭的複製品。
在琥珀與複製品的互動中，我觀察到菲莉婭有些微變化。似是憋在心中的煩惱得到解決一樣，她似乎願意活下去了吧？那就好了，那麼可以為「如何讓菲莉婭脫離戰場，回到家人身邊幸福生活」這目標作準備了。
很快契機就出現了——代號為N-014的複製品失控暴走，更控制桑納托斯量產型暴亂。
要是能夠透過睡神系統奪得控制權，並且讓它們連同原型機都一同自爆掉的話，那就可以毀掉整個桑納托斯系列，從而讓菲莉婭能夠從這個枷鎖脫離吧？
但是菲莉婭似乎想要幫助N-014，所以我把兩人從駕駛艙排出，這樣就能毫無顧忌的去把桑納托斯都拿去自爆吧？雖然睡神需要菲莉婭的腦電波去進行解鎖，但是經過這一年的不斷破解，以及這幾個月裡觀察菲莉婭的腦電波反應，可以透過模擬出腦電波的方式來啟動睡神，因此我才能夠帶著目測幾十臺量產機自爆。
雖然以後少了我可能會寂寞，但是她已經找回親人了，而且……她不會再輕易的放棄自己、不再需要我擔心了。所以好好的生活下去，並找到幸福吧！
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